Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf2Q9CQJ4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf2Q9CQJ4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf2Q9CQJ4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf2Q9CQJ4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf2Q9CQJ4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf2Q9CQJ4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf2Q9CQJ4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf2Q9CQJ4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rnf2Q9CQJ4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Rnf2Q9CQJ4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Rnf2Q9CQJ4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf2Q9CQJ4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf2Q9CQJ4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf2Q9CQJ4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Rnf2Q9CQJ4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Rnf2Q9CQJ4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rnf2Q9CQJ4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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