Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPZ1

Ccdc198, Uncharacterized protein CCDC198, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc198Q9CPZ1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccdc198Q9CPZ1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccdc198Q9CPZ1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms