Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nsmce3Q9CPR8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nsmce3Q9CPR8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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