Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Bhlhe41Q99PV5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Bhlhe41Q99PV5 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Bhlhe41Q99PV5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms