Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prpf8Q99PV0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Prpf8Q99PV0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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