Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GpnmbQ99P91 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
GpnmbQ99P91 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms