Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mrpl3Q99N95 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mrpl3Q99N95 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Mrpl3Q99N95 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms