Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl43Q99N89 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl43Q99N89 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mrpl43Q99N89 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl43Q99N89 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl43Q99N89 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mrpl43Q99N89 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Mrpl43Q99N89 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Mrpl43Q99N89 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Mrpl43Q99N89 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Mrpl43Q99N89 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Mrpl43Q99N89 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Mrpl43Q99N89 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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