Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PccbQ99MN9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PccbQ99MN9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms