Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Chmp1b1Q99LU0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Chmp1b1Q99LU0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms