Protein–RNA interactions for Protein: Q99LL3

Chst12, Carbohydrate sulfotransferase 12, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst12Q99LL3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Chst12Q99LL3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Chst12Q99LL3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms