Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG2

Tnpo2, Transportin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo2Q99LG2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tnpo2Q99LG2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tnpo2Q99LG2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms