Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nlgn1Q99K10 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nlgn1Q99K10 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms