Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Higd1bQ99JY6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Higd1bQ99JY6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms