Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Slc8b1Q925Q3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Slc8b1Q925Q3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms