Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Ripply3Q924S9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ripply3Q924S9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms