Protein–RNA interactions for Protein: Q923Z4

Ferd3l, Fer3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ferd3lQ923Z4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ferd3lQ923Z4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Gm16140-201ENSMUST00000117191 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ferd3lQ923Z4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.5 ms