Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZD5

Cts3, Cathepsin-3, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cts3Q91ZD5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cts3Q91ZD5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cts3Q91ZD5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms