Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cacng8Q8VHW2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacng8Q8VHW2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacng8Q8VHW2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacng8Q8VHW2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cacng8Q8VHW2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cacng8Q8VHW2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms