Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms