Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Stx18Q8VDS8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Stx18Q8VDS8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms