Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cep57l1Q8VDS7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cep57l1Q8VDS7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms