Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Fam20bQ8VCS3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam20bQ8VCS3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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