Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Rdh10Q8VCH7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rdh10Q8VCH7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rdh10Q8VCH7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rdh10Q8VCH7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
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Rdh10Q8VCH7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rdh10Q8VCH7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rdh10Q8VCH7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Rdh10Q8VCH7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
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Rdh10Q8VCH7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rdh10Q8VCH7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Rdh10Q8VCH7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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