Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3J4

Mterf3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf3Q8R3J4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Mterf3Q8R3J4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mterf3Q8R3J4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms