Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Trim29Q8R2Q0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Trim29Q8R2Q0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trim29Q8R2Q0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms