Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2E6

V1ra11, Vomeronasal type-1 receptor A11, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra11Q8R2E6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
V1ra11Q8R2E6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
V1ra11Q8R2E6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
V1ra11Q8R2E6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms