Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2A9

Vmn1r229, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r229Q8R2A9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r229Q8R2A9 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r229Q8R2A9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms