Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Treml1Q8K558 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Treml1Q8K558 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms