Protein–RNA interactions for Protein: Q8K449

Abca9, ATP-binding cassette sub-family A member 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca9Q8K449 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abca9Q8K449 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Abca9Q8K449 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abca9Q8K449 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abca9Q8K449 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abca9Q8K449 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Abca9Q8K449 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Abca9Q8K449 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Abca9Q8K449 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Abca9Q8K449 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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Abca9Q8K449 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
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Abca9Q8K449 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
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Abca9Q8K449 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
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Abca9Q8K449 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
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Abca9Q8K449 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Abca9Q8K449 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Abca9Q8K449 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
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