Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r72Q8K3N7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r72Q8K3N7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms