Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ssh3Q8K330 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms