Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Brd3Q8K2F0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Brd3Q8K2F0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms