Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Neil3Q8K203 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Neil3Q8K203 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms