Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0V4

Cnot3, CCR4-NOT transcription complex subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot3Q8K0V4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cnot3Q8K0V4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cnot3Q8K0V4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.8 ms