Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF1

Arhgap29, Rho GTPase-activating protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap29Q8CGF1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Arhgap29Q8CGF1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Arhgap29Q8CGF1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms