Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV0

Ccdc178, Coiled-coil domain-containing protein 178, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc178Q8CDV0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc178Q8CDV0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc178Q8CDV0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms