Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ufl1Q8CCJ3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ufl1Q8CCJ3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ufl1Q8CCJ3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms