Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAE9

Podxl2, Podocalyxin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Podxl2Q8CAE9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Podxl2Q8CAE9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Podxl2Q8CAE9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms