Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Spef2Q8C9J3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Spef2Q8C9J3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Spef2Q8C9J3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms