Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z9

4930504O13Rik, RIKEN cDNA 4930504O13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930504O13RikQ8C5Z9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4930504O13RikQ8C5Z9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4930504O13RikQ8C5Z9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.3 ms