Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5Z3

Ssxb2, Synovial sarcoma, X member B2, mousemouse

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb2Q8C5Z3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ssxb2Q8C5Z3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ssxb2Q8C5Z3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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