Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ccdc113Q8C5T8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ccdc113Q8C5T8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc113Q8C5T8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc113Q8C5T8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc113Q8C5T8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Ccdc113Q8C5T8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc113Q8C5T8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Ccdc113Q8C5T8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc113Q8C5T8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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