Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfrp1Q8C4U3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sfrp1Q8C4U3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms