Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atg16l1Q8C0J2 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atg16l1Q8C0J2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms