Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FarsaQ8C0C7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FarsaQ8C0C7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms