Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 2310061N02Rik-201ENSMUST00000050882 794 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm2030-201ENSMUST00000119590 1129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm16133-202ENSMUST00000160278 565 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Trim35Q8C006 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Trim35Q8C006 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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