Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rbbp5Q8BX09 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rbbp5Q8BX09 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms