Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Ctdsp2Q8BX07 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Ctdsp2Q8BX07 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ctdsp2Q8BX07 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Ctdsp2Q8BX07 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ctdsp2Q8BX07 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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