Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Usp38Q8BW70 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp38Q8BW70 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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